FOXN1

FOXN1
Ідентифікатори
Символи FOXN1, FKHL20, RONU, WHN, forkhead box N1, TIDAND, TLIND
Зовнішні ІД OMIM: 600838 MGI: 102949 HomoloGene: 2664 GeneCards: FOXN1
Пов'язані генетичні захворювання
T-cell immunodeficiency, congenital alopecia, and nail dystrophy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

hair follicle development
defense response
nail development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
blood vessel morphogenesis
thymus epithelium morphogenesis
thymus development
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
lymphocyte homeostasis
positive regulation of hair follicle development
epithelial cell proliferation
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
regulation of positive thymic T cell selection
keratinocyte differentiation
lymphoid lineage cell migration into thymus
T cell homeostasis
multicellular organism development
regulation of T cell differentiation in thymus
epidermis development
animal organ morphogenesis
регуляція експресії генів
проліферація
T cell lineage commitment
positive regulation of epithelial cell differentiation
диференціація клітин
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
кровотворення

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8456
15218
Ensembl
ENSG00000109101
ENSMUSG00000002057
UniProt
O15353
Q61575
RefSeq (мРНК)
NM_003593
NM_001369369
NM_001277290
NM_008238
RefSeq (білок)
NP_003584
NP_001356298
NP_001264219
NP_032264
Локус (UCSC) Хр. 17: 28.51 – 28.54 Mb Хр. 11: 78.25 – 78.28 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXN1 (англ. Forkhead box N1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 648 амінокислот, а молекулярна маса — 68 925[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVSLPPPQSDVTLPGPTRLEGERQGDLMQAPGLPGSPAPQSKHAGFSCSS
FVSDGPPERTPSLPPHSPRIASPGPEQVQGHCPAGPGPGPFRLSPSDKYP
GFGFEEAAASSPGRFLKGSHAPFHPYKRPFHEDVFPEAETTLALKGHSFK
TPGPLEAFEEIPVDVAEAEAFLPGFSAEAWCNGLPYPSQEHGPQVLGSEV
KVKPPVLESGAGMFCYQPPLQHMYCSSQPPFHQYSPGGGSYPIPYLGSSH
YQYQRMAPQASTDGHQPLFPKPIYSYSILIFMALKNSKTGSLPVSEIYNF
MTEHFPYFKTAPDGWKNSVRHNLSLNKCFEKVENKSGSSSRKGCLWALNP
AKIDKMQEELQKWKRKDPIAVRKSMAKPEELDSLIGDKREKLGSPLLGCP
PPGLSGSGPIRPLAPPAGLSPPLHSLHPAPGPIPGKNPLQDLLMGHTPSC
YGQTYLHLSPGLAPPGPPQPLFPQPDGHLELRAQPGTPQDSPLPAHTPPS
HSAKLLAEPSPARTMHDTLLPDGDLGTDLDAINPSLTDFDFQGNLWEQLK
DDSLALDPLVLVTSSPTSSSMPPPQPPPHCFPPGPCLTETGSGAGDLAAP
GSGGSGALGDLHLTTLYSAFMELEPTPPTAPAGPSVYLSPSSKPVALA

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Schorpp M., Hofmann M., Dear T.N., Boehm T. (1997). Characterization of mouse and human nude genes. Immunogenetics. 46: 509—515. PMID 9321431 DOI:10.1007/s002510050312

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з FOXN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12765 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, O15353 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші