DR1

DR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1JFI

Ідентифікатори
Символи DR1, NC2, NC2-BETA, NC2B, down-regulator of transcription 1, NCB2
Зовнішні ІД OMIM: 601482 MGI: 1100515 HomoloGene: 38809 GeneCards: DR1
Онтологія гена
Молекулярна функція

TBP-class protein binding
DNA binding
transcription factor binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001106 transcription corepressor activity
protein heterodimerization activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity

Клітинна компонента

клітинне ядро
negative cofactor 2 complex

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
histone H3 acetylation
transcription, DNA-templated
ремоделювання хроматину
regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
RNA polymerase II preinitiation complex assembly
transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1810
13486
Ensembl
ENSG00000117505
ENSMUSG00000029265
UniProt
Q01658
Q91WV0
RefSeq (мРНК)
NM_001938
NM_026106
RefSeq (білок)
NP_001929
NP_080382
Локус (UCSC) Хр. 1: 93.35 – 93.37 Mb Хр. 5: 108.42 – 108.43 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DR1 (англ. Down-regulator of transcription 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 176 амінокислот, а молекулярна маса — 19 444[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASSSGNDDDLTIPRAAINKMIKETLPNVRVANDARELVVNCCTEFIHLI
SSEANEICNKSEKKTISPEHVIQALESLGFGSYISEVKEVLQECKTVALK
RRKASSRLENLGIPEEELLRQQQELFAKARQQQAELAQQEWLQMQQAAQQ
AQLAAASASASNQAGSSQDEEDDDDI

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Inostroza J.A., Mermelstein F.H., Ha I., Lane W.S., Reinberg D. (1992). Dr1, a TATA-binding protein-associated phosphoprotein and inhibitor of class II gene transcription. Cell. 70: 477—489. PMID 1339312 DOI:10.1016/0092-8674(92)90172-9
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Cowell I.G., Hurst H.C. (1996). Protein-protein interaction between the transcriptional repressor E4BP4 and the TBP-binding protein Dr1. Nucleic Acids Res. 24: 3607—3613. PMID 8836190 DOI:10.1093/nar/24.18.3607
  • Goppelt A.R., Stelzer G., Lottspeich F., Meisterernst M. (1996). A mechanism for repression of class II gene transcription through specific binding of NC2 to TBP-promoter complexes via heterodimeric histone fold domains. EMBO J. 15: 3105—3116. PMID 8670811

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3017 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  4. UniProt, Q01658 (англ.) . Архів оригіналу за 24 квітня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»