SERBP1

СЕРПИН1 мРНК связывающий белок 1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

3J3A

Идентификаторы
Символ SERBP1 ; CHD3IP; HABP4L; PAI-RBP1; PAIRBP1
Внешние ID OMIM: 607378 MGI: 1914120 HomoloGene: 134277 GeneCards: Ген SERBP1
Функция • mRNA 3'-UTR binding

• protein binding

• poly(A) RNA binding
Компонент клетки • nucleus

• cytoplasm
• plasma membrane
• membrane
• perinuclear region of cytoplasm

• extracellular vesicular exosome
Биологический процесс • regulation of apoptotic process
• regulation of mRNA stability
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 26135 66870
Ensembl ENSG00000142864 ENSMUSG00000036371
UniProt Q8NC51 Q9CY58
RefSeq (мРНК) NM_001018067 NM_001113564
RefSeq (белок) NP_001018077 NP_001107036
Локус (UCSC) Chr 1:
67.87 – 67.9 Mb		 Chr 6:
67.27 – 67.29 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Ингибитор активатора плазминогена 1 РНК-связывающий белок SERBP1 (не следует путать с srebp1) — белок, который у человека кодируется геном SERBP1 .[1][2][3]


Взаимодействия

SERBP1, как было выявлено, взаимодействует с CHD3.[4][5]

Примечания

  1. ↑ Heaton J.H., Dlakic W.M., Dlakic M., Gelehrter T.D. Identification and cDNA cloning of a novel RNA-binding protein that interacts with the cyclic nucleotide-responsive sequence in the Type-1 plasminogen activator inhibitor mRNA (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2001. — May (vol. 276, no. 5). — P. 3341—3347. — doi:10.1074/jbc.M006538200. — PMID 11001948.
  2. ↑ Lai C.H., Chou C.Y., Ch'ang L.Y., Liu C.S., Lin W. Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics (англ.) // Genome Res[англ.] : journal. — 2000. — August (vol. 10, no. 5). — P. 703—713. — doi:10.1101/gr.10.5.703. — PMID 10810093. — PMC 310876.
  3. ↑ Entrez Gene: SERBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  4. ↑ Lemos, Taíla A; Passos Dario O; Nery Flávia C; Kobarg Jörg. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3 (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — Netherlands, 2003. — January (vol. 533, no. 1—3). — P. 14—20. — ISSN 0014-5793. — doi:10.1016/S0014-5793(02)03737-7. — PMID 12505151.
  5. ↑ Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome (англ.) // Cell : journal. — United States: Cell Press, 2005. — September (vol. 122, no. 6). — P. 957—968. — ISSN 0092-8674. — doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. — PMID 16169070.

Литература

  • Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides. (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
  • Andersson B., Wentland M.A., Ricafrente J.Y., et al. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction. (англ.) // Anal. Biochem.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 236, no. 1. — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
  • Yu W., Andersson B., Worley K.C., et al. Large-scale concatenation cDNA sequencing. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 7, no. 4. — P. 353—358. — doi:10.1101/gr.7.4.353. — PMID 9110174. — PMC 139146.
  • Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., et al. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library. (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
  • Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 3. — P. 422—435. — doi:10.1101/gr.GR1547R. — PMID 11230166. — PMC 311072.
  • Bucková D., Izakovicová Hollá L., Vácha J. Polymorphism 4G/5G in the plasminogen activator inhibitor-1 (PAI-1) gene is associated with IgE-mediated allergic diseases and asthma in the Czech population. (англ.) // Allergy : journal. — 2002. — Vol. 57, no. 5. — P. 446—448. — doi:10.1034/j.1398-9995.2002.03582.x. — PMID 11972486.
  • Jones K., Powell J., Brown L., et al. The influence of 4G/5G polymorphism in the plasminogen activator inhibitor-1 gene promoter on the incidence, growth and operative risk of abdominal aortic aneurysm. (англ.) // European Journal of Vascular and Endovascular Surgery[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 23, no. 5. — P. 421—425. — doi:10.1053/ejvs.2002.1633. — PMID 12027469.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3. (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 533, no. 1—3. — P. 14—20. — doi:10.1016/S0014-5793(02)03737-7. — PMID 12505151.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Otsuki T., Ota T., Nishikawa T., et al. Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 12, no. 2. — P. 117—126. — doi:10.1093/dnares/12.2.117. — PMID 16303743.
  • Lemos T.A., Kobarg J. CGI-55 interacts with nuclear proteins and co-localizes to p80-coilin positive-coiled bodies in the nucleus. (англ.) // Cell Biochem. Biophys.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 44, no. 3. — P. 463—474. — doi:10.1385/CBB:44:3:463. — PMID 16679534.
  • Passos D.O., Bressan G.C., Nery F.C., Kobarg J. Ki-1/57 interacts with PRMT1 and is a substrate for arginine methylation. (англ.) // FEBS J.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 273, no. 17. — P. 3946—3961. — doi:10.1111/j.1742-4658.2006.05399.x. — PMID 16879614.
  • Dalmáz C.A., Santos K.G., Botton M.R., et al. Relationship between polymorphisms in thrombophilic genes and preeclampsia in a Brazilian population. (англ.) // Blood Cells Mol. Dis.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 37, no. 2. — P. 107—110. — doi:10.1016/j.bcmd.2006.07.005. — PMID 16963292.
  • Beausoleil S.A., Villén J., Gerber S.A., et al. A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. (англ.) // Nat. Biotechnol. : journal. — 2006. — Vol. 24, no. 10. — P. 1285—1292. — doi:10.1038/nbt1240. — PMID 16964243.
  • Olsen J.V., Blagoev B., Gnad F., et al. Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2006. — Vol. 127, no. 3. — P. 635—648. — doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. — PMID 17081983.