Синдекан 1
Синдекан 1 | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Доступные структуры | |||||||||||
PDB | Поиск ортологов: PDBe, RCSB | ||||||||||
Список идентификаторов PDB 4GVC, 4GVD | |||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||
Символ | SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan | ||||||||||
Внешние ID | OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: Ген SDC1 | ||||||||||
| |||||||||||
Профиль экспрессии РНК | |||||||||||
Больше информации | |||||||||||
Ортологи | |||||||||||
Вид | Человек | Мышь | |||||||||
Entrez | 6382 | 20969 | |||||||||
Ensembl | ENSG00000115884 | ENSMUSG00000020592 | |||||||||
UniProt | P18827 | P18828 | |||||||||
RefSeq (мРНК) | NM_001006946 | NM_011519 | |||||||||
RefSeq (белок) | NP_001006947 | NP_035649 | |||||||||
Локус (UCSC) | Chr 2: 20.4 – 20.43 Mb | Chr 12: 8.77 – 8.79 Mb | |||||||||
Поиск в PubMed | Искать | Искать |
Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1.
Функции
Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.[1]
Структура
Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1.
Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживления раны.
Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин.
Применение
Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток[2], если известно, что клетки произошли из клеток крови.[3]
См. также
- Синдеканы
- Синдекан 2
Примечания
- ↑ Entrez Gene: SDC1 syndecan 1 (неопр.).
- ↑ Rawstron A.C. Immunophenotyping of plasma cells (неопр.) // Curr Protoc Cytom. — 2006. — May (т. Chapter 6). — С. Unit6.23. — ISBN 0-471-14295-6. — doi:10.1002/0471142956.cy0623s36. — PMID 18770841.
- ↑ O'Connell F.P., Pinkus J.L., Pinkus G.S. CD138 (syndecan-1), a plasma cell marker immunohistochemical profile in hematopoietic and nonhematopoietic neoplasms (англ.) // Am. J. Clin. Pathol. : journal. — 2004. — February (vol. 121, no. 2). — P. 254—263. — doi:10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L. — PMID 14983940. Архивировано 9 июня 2011 года. (недоступная ссылка)
Литература
- Teng Y.H., Aquino R.S., Park P.W. Molecular functions of syndecan-1 in disease (англ.) // Matrix Biol.[англ.] : journal. — 2012. — January (vol. 31, no. 1). — P. 3—16. — doi:10.1016/j.matbio.2011.10.001. — PMID 22033227.
- Katz B.Z. Adhesion molecules--The lifelines of multiple myeloma cells (англ.) // Semin. Cancer Biol. : journal. — 2010. — June (vol. 20, no. 3). — P. 186—195. — doi:10.1016/j.semcancer.2010.04.003. — PMID 20416379.
- Bass M.D., Morgan M.R., Humphries M.J. Syndecans shed their reputation as inert molecules (англ.) // Sci Signal[англ.] : journal. — 2009. — March (vol. 2, no. 64). — P. pe18. — doi:10.1126/scisignal.264pe18. — PMID 19336838. — PMC 3328204.
Ссылки
- Клеточный матрикс. Синдекан.